在处理个人所得税申请城市和任职单位不一致的问题时，存在一些特殊情况或例外情形，会对处理方式产生影响：
1. 外派单位实际支付薪资：若您被任职单位外派到其他城市工作，且薪资实际由外派单位支付，而非原任职单位。这种情况下，根据“支付所得的单位为扣缴义务人”的规定，您的个人所得税申报城市应是外派单位所在地，而非原任职单位所在地。这会导致申请城市与原任职单位不一致，此时需以外派单位所在地为申报城市。
2. 存在多处工资薪金所得：如果您同时在两个或两个以上单位任职受雇并取得工资薪金所得，每个支付所得的单位都会在其所在地为您申报个人所得税。这种情况下，您的个人所得税申请城市会有多个（分别对应不同任职单位所在地），与单一任职单位所在地自然不一致。此时，您需要在次年规定时间内办理汇算清缴，合并申报全部所得。
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个人所得税申请城市和任职单位不一致，可能会给您带来以下法律风险：
1. 补税、滞纳金及罚款风险：若因申报城市与任职单位不一致导致个人所得税申报错误、少缴或漏缴税款，税务机关会要求您补缴税款，并从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金；情节严重的，还可能面临罚款。例如，您本应在A市（任职单位所在地）申报个税，但错误地在B市申报且少缴了税款，税务机关核查后会要求您补缴税款、滞纳金。
2. 影响个人税务信用风险：个人所得税申报情况是个人信用信息的重要组成部分，申报城市和任职单位不一致若被认定为申报异常或违规，可能会影响您的个人税务信用记录。这可能导致您在未来办理贷款、出国、担任企业高管等方面受到限制。例如，税务信用等级被降级后，银行在审批贷款时可能会拒绝您的申请。
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针对个人所得税申请城市和任职单位不一致的情况，我们可以依据《中华人民共和国个人所得税法》来明确申报责任。
根据2018年修正版《中华人民共和国个人所得税法》第九条规定：“个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。” 您的问题核心在于确定“支付所得的单位”。如果您的工资薪金是由任职单位（即签订劳动合同的单位）支付的，那么无论您实际工作城市在哪里，任职单位作为扣缴义务人，应在其所在地为您申报个人所得税，此时申请城市应与任职单位所在地一致。若申请城市与任职单位不一致，可能是因为支付所得的单位与任职单位并非同一主体，这就需要根据实际支付情况来确定正确的申报城市和扣缴义务人。因此，适用该法条，您的个人所得税申报城市原则上应与支付您所得的单位（通常是任职单位）所在地一致。
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您遇到的个人所得税申请城市和任职单位不一致的问题，通常情况下应优先以支付所得的单位所在地为准进行申报。

以下是不同情况的详细说明：
1. 若存在与您签订劳动合同且实际支付工资薪金的是原任职单位，即使您被外派到其他城市工作，个人所得税仍应由原任职单位在其所在地代扣代缴并申报。
2. 若存在外派单位实际承担您的薪资支付责任，且您与外派单位存在实际的雇佣关系或薪资支付事实，则可能需要在外派单位所在地进行个人所得税申报。
3. 若存在您在两处或两处以上取得工资薪金所得的情况，任职单位会分别在各自所在地为您申报，您则需要在次年3月1日至6月30日内，选择并固定向其中一处单位所在地主管税务机关办理汇算清缴申报。

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